一款在线生物信息可视化工具,用于绘制、展示和注释生物进化树(phylogenetic tree)。该工具可以导入不同格式的进化树文件,如Newick、Nexus和Phylip等,也可以与其他在线数据库(如NCBI和UNIPROT)进行交互。
一种常用的序列比对算法,可以寻找两个序列之间的相似性,或从一个序列集中查找与查询序列相似的序列。
在线的全局序列比对工具,由欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)的研究人员开发和维护。Needle的主要任务是对两个序列进行全局比对,为生命科学研究提供支持和服务。
在线的抗体验证数据库,由美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员开发和维护。VAD的主要任务是收集和整理已经验证过的抗体信息,为生命科学研究提供支持和服务。
在线的蛋白质互作网络分析工具,由瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员开发和维护。STRING的主要任务是对蛋白质进行互作网络分析,为生命科学研究提供支持和服务。
在线的生物信息学工具,由美国国立卫生研究院的研究人员开发和维护。DAVID的主要任务是对基因和蛋白质进行功能注释和生物信息学分析,为生命科学研究提供支持和服务。
在线的信号肽预测工具,由丹麦技术大学的研究人员开发和维护。SignalP的主要任务是预测蛋白质中可能存在的信号肽序列,为生命科学研究提供支持和服务。
在线的蛋白质磷酸化位点预测工具,由丹麦技术大学的研究人员开发和维护。NetPhos的主要任务是预测蛋白质中可能被磷酸化的位点,为生命科学研究提供支持和服务。
在线的基因启动子预测工具,由美国加州大学伯克利分校的研究人员开发和维护。Promoter的主要任务是预测基因的启动子区域,为生命科学研究提供支持和服务。
基于深度学习的跨膜蛋白质预测工具,由中国科学院计算技术研究所的研究人员开发和维护。DeepTMHMM的主要任务是预测蛋白质的跨膜结构,为生命科学研究提供支持和服务。
在线的蛋白质结构预测工具,由瑞士巴塞尔大学的研究人员开发和维护。SwissModel的主要任务是预测蛋白质的三维结构,为生命科学研究提供支持和服务。
法国生物信息学和计算生物学研究中心(Centre de Bioinformatique de Bordeaux)的在线生物信息学平台,提供了多种生物信息学工具和数据库,为生命科学研究提供支持和服务。
PredictProtein是一个在线的蛋白质结构和功能预测工具,由德国海德堡大学的研究人员开发和维护。PredictProtein的主要任务是预测蛋白质的结构和功能,为生命科学研究提供支持和服务。
早期的蛋白质亚细胞定位预测工具,由瑞典乌普萨拉大学的研究人员开发和维护。
在线的蛋白质亚细胞定位预测工具,由瑞典斯德哥尔摩大学的研究人员开发和维护。TargetP 2.0的主要任务是预测蛋白质的亚细胞定位,为生命科学研究提供支持和服务。
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